جراثيم بمعنى ابواغ و هي خلايا ناتج من تحول الظروف الملائمة للكائن الحي الدقيق الى ظروف غير الملائمة و توجد في البكتيريا و الفطريات و بعض الكائنات الاخرى الدقيقةاو بشكل اعم يقال جراثيم بشكل مكافئ للكائنات الدقيقةMICROORGANISM او GREMS او ميكروب فهي بهدا تشمل جميع الاحياء الدقيقة وحيدة الخلية بما فيها الفيروسات والبكتريات و الفطريات و هي مجموع لا تتشارك لا بالصفات ولا بالخصائص الحيوية لدا لا يمكن اعتبارها مجموعة متجانس باي حال